东湖高新区光谷运输有限公司旗下有多家子公司。

分别是湖北路桥集团有限公司、上海泰信环境工程有限公司、武汉光谷环保科技有限公司、武汉东湖高新园区发展有限公司、合肥东湖高新投资有限公司、杭州东湖高新投资有限公司、武汉光谷加速器投资发展有限公司、保定耀润水务有限公司、武汉联投佩尔置业有限公司等。

子公司在法律上独立于母公司，具有独立完整的公司管理组织体系，因此在经营上具有较大的独立性和一定的灵活性。