独立子公司和母公司还有关系吗？

没事的。母公司和子公司虽然实际上是控股关系，但在法律上实际上是两个独立的民事主体。

法律依据:

《中华人民共和国公司法》第二十六条有限责任公司的注册资本为在公司登记机关登记的全体股东认缴的出资额。法律、行政法规和国务院决定对有限责任公司注册资本实收情况和注册资本最低限额另有规定的，从其规定。