高通量测序的测序平台
自从2005年454生命科学公司(2007年正式被罗氏收购)推出454 FLX焦磷酸测序平台后,因为他们的旗舰产品系列毛细管阵列电泳测序仪遇到了两个强大的竞争对手,曾经推出3730xl DNA分析仪的应用生物系统(ABI)的领先地位开始动摇,该仪器一直占据测序市场的最大份额。一个是罗氏的454测序仪。另一个是2006年美国Illumina公司推出的Solexa基因组分析仪平台。为此,ABI公司在2007年推出了自己的固体测序仪。这三个测序平台是目前高通量测序平台的代表。(见表1)公司名称、技术原理、技术开发者的商业模式、Apply Biosystems(ABI)基于磁珠的大规模平行克隆和DNA测序方法Agencourt Private Genomics Company(APG)美国上市公司:出售设备和试剂获利Illumina合成测序方法英国Solexa公司首席科学家戴维·本特利,上市公司:出售设备和试剂获利罗氏大规模平行焦磷酸合成测美国454生命科学公司创始人乔纳森·罗斯伯格(Jonathan Rothberg)列举的是一家公司:出售设备和试剂获利。该产品已于2013停产。Helicos大规模并行单分子合成测序方法Stephen Quake,美国斯坦福大学生物工程师,上市:首次公开发行(IPO)2007年5月(P.S .由于平台准确率低,公司于2012年宣布破产)Complete Genomics DNA纳米阵列和组合探针锚定连接测序方法radoje drmanac私营公司,美国Complete Genomics公司首席科学家:投资4650万美元,公司于2065438+年被华大基因收购表1:主流测序平台概述
罗氏454焦磷酸测序
(焦磷酸测序)
Illumina Solexa合成测序
(通过合成排序)
Illumina基因组分析仪的测序原理
Illumina新一代测序仪Hiseq 2000和Hiseq 2500具有高精度、高高通容量、高灵敏度、低运行成本等突出优势,可同时完成传统基因组学研究(测序和注释)和功能基因组学研究(基因表达和调控、基因功能、蛋白质/核酸相互作用)。Hiseq是一种基于单分子簇的测序技术,基于化学反应可逆终止的原理。在测序过程中,基因组DNA的随机片段附着在光学透明的玻璃表面(即流动池)。经过延伸和桥接扩增,在流动细胞上形成了数以亿计的簇,每个簇都是单个分子簇,具有数千个相同模板的拷贝。然后,用四种带有荧光基团的特殊脱氧核苷酸和可逆终止SBS(边合成边测序)技术对待测模板DNA进行测序。
ABI固体连接测序
(通过连接的序列)