公司扣除个人所得税但不缴纳。

个人所得税一般由公司缴纳。每月工资扣除每月五险一金，然后免税金额3500元。以上金额乘以适用税率，最终金额为个税。

法律客观性:

《中华人民共和国个人所得税法》第六条应纳税所得额的计算: (一)居民个人的综合所得，以每一纳税年度的收入额减除费用六万元后的余额，再减除专项附加扣除和其他依法确定的扣除后的余额，为应纳税所得额。(二)非居民个人的工资、薪金所得，以月收入减除费用五千元后的余额为应纳税所得额；劳务报酬所得、稿酬所得、特许权使用费所得，应当纳税。(三)经营所得，以每一纳税年度的收入总额减除成本、费用和损失后的余额为应纳税所得额。(四)财产租赁收入每次不超过4000元的，减除费用800元；超过4000元的，扣除20%的费用，余额为应纳税所得额。(五)财产转让所得，以财产转让所得减除财产原值和合理费用后的余额为应纳税所得额。(六)利息、股息、红利所得和偶然所得，以每次应纳税所得额为限。劳务报酬所得、稿酬所得、特许权使用费所得，为减除费用后的余额。稿酬所得数额应减少70%。个人将其所得捐赠给教育、扶贫、脱贫等公益性慈善机构，捐赠额不超过纳税人申报应纳税所得额30%的部分，可以在其应纳税所得额中扣除；国务院规定对慈善事业的捐赠应当在税前全额扣除的，从其规定。本条第一款第一项规定的专项扣除，包括居民个人按照国家规定的范围和标准缴纳的基本养老保险、基本医疗保险、失业保险、住房公积金等社会保险费；专项附加扣除包括子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息或住房租金、赡养老人等费用，具体范围、标准和实施步骤由国务院确定，并报NPC人大常委会备案。