证券事务代表工作初期需要有董秘资格证吗？还是以后再考？新三板挂牌的公司呢？

认证机构并没有规定董秘资格证是必须的。一般认证机构需要有相关工作经验或者相关专业。新三板公司的创新公司取得董秘资格证书是强制性的，但新三板的基础水平没有强制性要求。上市公司的董秘自然需要董秘证。

从你的问题可以看出，你并没有明确新三板的挂牌公司和上市公司的区别。这是两个概念。至于充当证人，不一定要考取秘书长证。当然，最好是获得它。