公司的代名词是她吗？

它或她都可以。如果你有感情，比如这是我们公司；在过去的十年里，她已经长到...可以用she来拟人化。如果觉得没必要加感情，就用吧。

另外，she不仅用于表达感情的名词，ship这个词一般都是she。