申请查封股权在案值上是全部查封还是部分查封？

把它封起来。根据《最高人民法院关于人民法院执行工作若干问题的规定(试行)》第五十二条规定，查封股份是指冻结股份，禁止股份转让或者交易。一旦被执行人或者债务人无法执行生效的裁决或者判决，人民法院可以通过执行被查封的股权，使债权人或者申请人获得股权转让补偿。人民法院可以扣押被执行人在其他股份有限公司持有的股票(股份)，依照《公司法》的有关规定强制被执行人转让，或者直接拍卖、变卖处理，或者将股份直接补偿给债权人，以清偿被执行人的债务。